南京科學園污水處理廠于2010年建設，江蘇南京科學園污水處理廠采用較為先進的污水處理工藝， 其設計規模為4萬立方米/日， 先期日處理規模達到4萬立方米/日，項目投資近6000萬元，江寧科學園污水處理廠由江寧水務集團公司承建，設計處理能力為每日8萬噸，服務范圍包括科學園一期和大學城一、二期及科學園研發區，服務面積50多平方公里，服務人口約40萬人。 工程分兩期建設，其中一期工程日處理能力4萬噸，主體投資6000萬元。工程于2006年11月動工興建，2007年12月通水試運行，2008年4月工藝調試成功，目前運行正常。這次開工建設的擴建工程，日處理能力為4萬噸，預算投資6000萬元，計劃2010年建成投入運營。 工程擬采用自動化程度較高的以雙溝式氧化溝為主體的二級生化處理工藝，出水經紫外消毒后達國家《城鎮污水處理廠污染物排放標準》一級A排放標準，外排秦淮河。南京科學園污水處理廠建成后將極大地改善了周圍水體環境，對治理水污染，保護當地流域水質和生態平衡具有十分重要的作用。