在厭氧生物處理反應器中．不產甲烷菌和產甲烷菌相互依賴，互為對方創造與維持生命活動所需要的良好環境和條件。但又相互制約。厭氧微生物群體間的相互關系表現在以下幾個方面：

A、不產甲烷細菌為產甲烷細菌提供生長和產甲烷所需要的基質；

B、不產甲烷細菌為產甲烷細菌創造適宜的氧化還原條件；

C、不產甲烷細菌為產甲烷細菌清除有毒物質；

D、產甲烷細菌由為不產甲烷細菌的生化反應解除反饋抑制；

E、不產甲烷細菌和產甲烷細菌共同維持環境中適宜的pH值